La gran mayoría del atún que compramos es capturada utilizando los métodos de pesca aprobados, con redes de cerco o el método de pole & line. A continuación se presenta brevemente esos dos métodos.
La pesca con redes de cerco es un método consistente y eficaz que permite a los buques de capturar y congelar grandes cantidades de atún. Los barcos de cerco pescan mediante la detección de bancos de atún que nadan libremente o utilizando objetos flotantes que atraen a los peces. Esos objetos pueden ser naturales o artificiales como los Dispositivos Agregadores de Peces (DAP).
En el método de Pole & Line, el atún es capturado uno por uno utilizando un anzuelo atado a una línea y una caña. La pesca con caña y línea se opera en varios lugares del mundo, incluido en Japón, Indonesia y las Maldivas. Pueden ser operaciones comerciales con tecnología avanzada u operaciones de menor escala o de carácter artesanal.